崇祯元年在陈于廷的帮助下被重新启用，官复原职。

不到三个月，就升为兵部右侍郎，镇守昌平，密云等地，而昌平又是大明皇陵的所在地，而且还收下了一个大明历史上举足轻重的人物--左良玉。

左良玉原本是山东临清人，后投身军伍，天启七年随军调入宁远，因功晋升为都司。

第二年因粮饷问题，宁远兵变爆发，宁远十三营的蜀、楚士卒，以张正朝、张思顺为首，歃血为盟，欲讨回欠发的四个月薪饷，他们攻入幕府，抓到前户部尚书毕自严的弟弟，关宁巡抚毕自肃。

而左良玉身为客军将领，当时麾下也同样缺吃少穿，便大着胆子抢掠了一把，好让底下的士兵不至于闹事，到手之后才发现是运往锦州的饷银，然后就被追责，本来是要砍头的，但是让他的好友邱磊扛了下来，左良玉也就夺去军职。

后来回山东的时候遇到侯恂，被侯恂看中，不计较他的罪责，就收入帐下，同样给予他都司的待遇。

至于为啥侯恂愿意帮助左良玉，是侯恂慧眼识珠，觉得左良玉能打仗么？其实并不是，主要是左良玉长得好。

明朝中叶以后，龙阳之风甚炽，军中不携妇人，常以面目姣好的兵卒陪酒侍寝，左良玉生的一副好皮囊，侯恂刚好也好这口，于是左良玉，就成了他的好朋友。

崇祯三年，鞑子为祸京畿，当时节制天下勤王兵马的山海关总兵马世龙，让左良玉率军出征，跟随游击将军曹文诏支援玉田、丰润，与鞑子在洪桥、大堑山、遵化等地大战，战后晋升为昌平参将，继续留在侯恂帐下。

崇祯四年的，大凌河之战，昌平副将尤世威要驻守皇陵，没办法率军出征，推荐左良玉代他率兵前往，仍旧由侯恂带队，松山，杏山与鞑子交战后，颇有斩获，虽然没有解大凌河之围，但还是官升副将。

到了今年，流寇由山西进入河南，直逼怀庆，同时孔有德在山东起兵，昌平总兵陈洪范率军到天津卫，与其余各部十余万兵马一起出征，现在被围困在

而作为昌平副总兵的左良玉，则率领五千兵马，进入河南剿贼，先左良玉左良玉驻军泽州，扼守河南、山西间咽喉地段，还可以作为四周的援兵。

按照洪承畴的谋划，左良玉和曹文诏，暂时接受河南巡抚樊尚的节制，原计划是曹文诏率领的陕西兵马向东进攻，河南兵力向北，左良玉堵住泽州，洪承畴率领本部主力，从北部压过来，准备一鼓作气消灭叛军在山西南部的流寇。

不过因为刘宇烈在昌乐的惨败，洪承畴不得不率领主力，进入东昌，汇合卢象升的天雄军，以及杨一鹏的漕运大军，在东昌府与叛军激战，防止叛军西进河南，与流寇同流合污。

与此同时，镇守昌平的侯恂，也被调派之通州，接替了当上山东巡抚的范景文的差事，继续在通州编练军队。

直到六月，因为剿抚之争，前户部尚书毕自严被罢免，他回京接任户部尚书一职。

可以说，他除开在翰林院和罢官在家的那几年，基本上都在军伍之中，虽然战阵指挥不一定出色，但对于兵事可比在场大多数人都要了解。

昌平镇的兵马，还有通州的兵马，到底是个什么水平，他都门清。

不说别的，尽管不及关宁军，但是昌平可是九边重镇之一，负责守卫皇陵，在九边之中，实力也仅次于宣府和大同两镇，通州军有徐光启和范景文两代编练，以及杨肇基麾下百战老兵的加入，实力更是不可小觑。

然而就是这样两支强军，前者现在被天策军围在章丘，新城一带，只能被动防守，后者除了继续留守通州的少量兵马，主力随着范景文一起进入山东平叛，在莱州被天策军被消灭的干干净净。

此外，他的弟弟侯恪是南京国子监祭酒，对于七月的那场‘倭寇来袭’，自然是了解的清清楚楚，对于侯恂没有丝毫隐瞒，基本上事无巨细，所有能获得的消息，都写信告诉了侯恂。

虽然那一次是孔有德打了个突然袭击，南京方面没有防备，而且武备废弛，但不得不说，能够从山东奔袭南京，这份实力可不是一般军队能够做到的。

而且南京就算再武备废弛，毕竟当了几十年的都城，坚固程度自不必说，可天策军连京师城都给攻破了，只不过有所顾忌，没有率军攻入城内罢了，并不是实力不够。

有丰富的战阵经验，而且又掌握着这么多有关天策军的资料，侯恂对天策军实力的把控，要高于在场的大部分人，甚至张凤翼这个兵部尚书，都不一定有他在行。

所以，在侯恂看来，天策军的实力，已经超过了关宁军，甚至在能比得上辽东的鞑子。

朝廷想要继续作战，在鞑子攻下锦州之前夺回山海关，根本就不可能。

侯恂知道天策军的硬实力，但陈于廷并不知道，他进入仕途基本就没离开过京城，对于战事也仅限于各种战报罢了，没有实地接触过战争，他可不认为天策军有这么强大的实力。

尤其是看到自己最为信赖的盟友，这个时候居然公开反对自己，有些不悦道“孔有德区区逆贼，不过是趁着官军不被，突然起兵，用劫掠而来的钱粮扩大军队罢了！

“范景文之败，可以说是轻敌大意，然此次刘宇烈总督山东平叛军务，麾下是关宁军，各边镇精兵，还有神机营的三营精锐兵马，一路势如破竹，歼灭为祸青州的白莲教十余万乱飞，对上孔有德所部叛军，缘何又大败而归，损失近半？还被孔贼趁势夺取大半山东？”

陈于廷被顶的哑口无言，随即温体仁站起来，满不在乎的说道“叛军区区数万兵马，朝廷确实战败两次，但如果吸取教训，总结经验，整兵再战，歼灭叛军不过是时日问题罢了！”

侯恂却丝毫不给面子的说道“敢问温阁老，可知晓领军作战，最重要的什么？”

“无非士气，钱粮，情报！”

“那好，请问这兵从何处来？钱粮又从何处来？关于叛军，我们又知晓多少？”

“我大明富有四海，可战之兵不下百万，若是从两广，江浙，南直隶，湖广，江西，四川，云贵等地调兵，无非是多花些时日，最多半年，调集三十万可战之军不在话下！

至于钱粮，该是你这个户部尚书负责，总理天下税赋，三十万战兵的粮饷总不至于负担不起吧！而情报，多派一些人去刺探即可，现在叛军占据山东，想要刺探情况并不困难！”

侯恂不为所动，继续反驳“我大明是有百万之兵，然能与强敌作战者能有几何？三十万内地大军，可否比得上此次平叛的十三万大军？”